"이동 유전자"를 사용한 유전자 분석의 효율성 향상 - 분석하기 어려운 작물에도 사용될 수 있습니다 -

2014 년 8 월 8 일

<작업 결과>
환경 및 생명 과학 대학원에서 게놈 유전자 분석학과의 타하라 마코토 교수, 오키마 아마 대학교, 유키 카도타 (Yuki Kadota) 특별 조교수, Shindo Akiko 연구 조교수, 농업 교수의 4 학년 학생들 "에 초점을 맞추고 효율적인 유전자 분석에 중점을두고있다. 시퀀싱. " 이로 인해 고구마 품종 사이의 유전 적 관계를 명확히하고 다양성을 식별하기 위해 DNA 마커의 성공적인 발달이 이루어졌습니다.
이 연구 결과는 2014 년 6 월 16 일 온라인 Scientific Journal "DNA Research"(Oxford Journals)에 발표되었습니다. 미국 온라인 출판물 GenomeWeb에서도 인터뷰가 소개되었습니다.
고구마는 다른 농산물과 비교하여 온라인 온라인 슬롯 추천 추천 분석하기가 매우 어렵고 DNA 마커의 발달이 지연되었습니다. 그 이유는 고구마가 다 배수체 (hexpolarized)이고 복잡한 유전학이 있기 때문입니다. 또한, 전체 게놈 서열 정보는 아직 해독되지 않았다. 그러나 유용한 품종을 효율적으로 배양하고 육종가의 특허권을 보호하기 위해서는 온라인 온라인 슬롯 추천 추천 정보를 사용하여 분석 방법을 확립하는 것이 필수적이었습니다.
따라서 이번에는 연구 그룹이 레트로 트랜스 포손이라는 "움직이는 유전자"에 중점을 두었습니다. 그것은 진핵 생물 (식물, 동물, 곰팡이 등)의 게놈에 존재하며 그들 자신의 사본을 만들어 늘릴 수 있습니다. 또한 새로 생성 된 사본은 DNA 서열에 있으면 안정적으로 상속됩니다. 따라서 품종 간의 다른 위치에있는 사본은 DNA 마커로 사용될 수 있습니다.
또한, 연구 그룹은 효율적인 유전자 분석을 수행하기 위해 최근 몇 년 동안 빠르게 인기를 얻은 "차세대 서열"을 사용합니다. 짧은 기간 동안, 우리는 수천만 명의 DNA 서열에 대한 데이터를 얻을 수있었습니다. 분석 결과는 고구마 품종 사이의 유전 적 관계를 밝혀 냈으며, 이들은 품종 사이의 이미 알려진 부모-자식 관계와 거의 일치한다는 것을 확인했습니다. 우리는 고구마에서 얻은 유전자 데이터를 사용하여 품종 관리를 달성 할 수 있음을 보여주었습니다. 또한, 우리는 품종을 식별하기 위해 DNA 마커를 성공적으로 개발했습니다. 이를 통해 품종을보다 정확하게 식별 할 수 있습니다 (그림).



<예비 결과>
현재, 다양한 농작물이 온라인 슬롯 추천 정보를 사용하여 분석되고 있습니다. 그러나 일부 농작물은 유 전적으로 분석하기가 어렵고 매우 진보되지 않았습니다. 고구마는 그중 하나입니다.
"이동 유전자"및 "차세대 시퀀싱"을 사용한 방법은 다른 농산물에도 사용될 수 있습니다. 따라서, 전체 게놈 서열이 아직 해독되지 않았거나 아직 분석되지 않은 작물조차도 유용한 농업 유전자를 효율적으로 발견 할 수있을 것으로 예상된다.
우리는 미래에 더 나은 번식 (질병 저항성, 맛, 영양가 등)을 개발하고 귀중한 일본 품종을 개발하려는 노력이 더욱 활발해질 것으로 기대합니다.

<추가 노트>plusploid : 2 개 이상의 염색체를 가진 개인을 나타냅니다. 일반적으로 수정 후 두 세트의 염색체가 물려납니다. 하나는 어머니와 아버지 (이배체)로부터 나온 것입니다. 인간을 포함한 많은 동물은 이배체입니다. 그러나, 대부분의 식물은 3 개의 세트 (트리 로이드) 및 4 개의 세트 (사면체)와 같은 2 개의 세트보다 더 많은 염색체를 가진 다 배체입니다. 예를 들어, 감자는 사면체이며 밀은 6 헥 세프로이드입니다.
게놈 서열 해독 : 유기체가 보유하는 모든 DNA의 기본 서열을 명확히하기 위해. 인간 게놈은 2003 년에 해독 된 것으로 선언되어 30 억 기초, A (아데닌), G (Guanine), T (티민) 및 C (시토신)가 연결된 순서를 나타냅니다. DNA의 기본 서열을 읽는 시퀀서 기술의 개발 및 개발을 통해, 다양한 종의 게놈 서열이 현재 디코딩되고있다.
Retrotransposon : 자체 사본 서열을 생성하고 증폭시키는 진핵 생물의 게놈에서 발견되는 전이성 DNA 서열 (Transposon)의 유형. 그것은 식물 게놈에서 특히 독특합니다. 게놈에는 수많은 레트로 트랜스 포손이 있지만, 게놈의 진화 동안 대부분의 증폭 기능이 상실되었습니다. 그러나, 레트로 트랜스 포손은 여전히 ​​드문 경우에 증폭 기능이있는 것으로 알려져있다.
차세대 시퀀스 : 이것은 최근 몇 년 동안 인기를 얻은 새로운 원리를 기반으로 시퀀서를 사용한 분석을 보여줍니다. 기존의 모세관 시퀀서와 비교하여, 분석 기능이 상당히 개선되어, 많은 양의 서열 데이터가 짧은 시간 내에 출력 될 수있게되었다. 유전학과 게놈 분석은 극적으로 진행되었으며 생명 과학에 혁명을 일으켰다.
이 연구는 2012-2014 년 농업 산림 및 수산부의 보조금으로 시행되었습니다.


게시 된 논문 : Monden Y, Yamamoto A, Shindo A, Tahara M. 벤치 탑 고격도 시퀀싱 플랫폼을 사용한 활성 레트로 트랜스 포슨 삽입 사이트의 표적화 된 시퀀싱에 기초한 효율적인 DNA 지문 :DNA 연구, 2014, (doi : 10.1093/dnares/dsu015)

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<연락처>
(제휴) Oknama University, 환경 및 생명 과학 대학원
교수, 게놈 유전학 분석
(이름) Tahara Makoto
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