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출처 : 에그 슬롯 (일본), 홍보 부서
즉시 릴리스 : 2021 년 12 월 24 일
에그 슬롯 Research : 자동화 된 셀 이미지 분석

(에그 슬롯사이트, 12 월 24 일)에그 슬롯의 연구원염색체 에그 슬롯세포의 광면경 에그 슬롯를 세포 분열이 아닌 것으로 자동으로 분류하는 도구. 딥 러닝 기술에 기초한이 도구는 염색체 (유전자 코드의 캐리어)가 세포 분열 동안 가장 쉽게 관찰되기 때문에 유전학 분야에 매우 중요하다.

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에그 슬롯원들은 자동화 된 셀 이미지 분석이 사용자 친화적이어야한다는 전제에서 시작했습니다. 기존의 딥 러닝 도구에는 일반적으로 명령 줄 인터페이스가 포함되며, 사용자는 유전 학자 기술 세트 (일반적으로 데이터 과학자로서 훈련되지 않은)를 넘어 설 수있는 특정 컴퓨팅 기술을 갖추어야합니다. 따라서 Nagaki 부교수와 동료들은 Apple의 생성 ML 응용 프로그램을 사용하여 그래픽 사용자 인터페이스 (GUI)를 개발하기로 결정했습니다. 나중에는 심도있는 습한 프레임 워크를 제공하는 무료 GUI 기반 개발자 도구입니다.

깊은 학습 접근법에는 알려진 내용이있는 '훈련'에그 슬롯 세트가 필요합니다. 세포 분열 과정에있는 셀 (유사 분열). 유사 분열 세포의 에그 슬롯는 염색체를 나타내고 다른 에그 슬롯는 그렇지 않습니다. 그런 다음 알고리즘은이 에그 슬롯 세트를 사용하여 '트레이닝'을하고 유사 분열 셀이 표시되는지 여부를 결정하기위한 고유 한 기준을 개발하여 실제로 분석 해야하는 에그 슬롯를 처리하는 데 적용 할 수 있습니다.

과학자들은 다른 종의 식물의 유사 분열 및 비 미묘한 세포의 다른 수의 이미지를 가진 훈련 세트로 테스트를 수행했습니다. 120 개 이상의 이미지를 가진 에그 슬롯터 세트는 플랜트 세포를 유사 분열 또는 비 미생물로 정확하게 분류 할 때 80% 이상의 정확도를 초래했습니다. Nagaki 부교수와 동료들은 또한 여러 종의 이미지를 사용하여 분류 정확도를 향상 시켰으며 분류가 훈련 세트에서 발생하지 않는 종에도 효과가 있음을 발견했습니다.

도구의 주요 제한 요소는 세계에서 가장 널리 퍼진 운영 체제 인 Windows에서 실행되지 않는다는 것입니다. 에그 슬롯원들은 저렴한 Mac을 얻음으로써 이러한 제한을 극복 할 수 있으며, 그들의 시스템은“모든 종류의 생물학적 이미지를 사용하여 분류하기위한 모델을 쉽게 구축 할 수 있기 때문에 누구나 사용할 수있는 딥 러닝 분류기로 사용할 가능성이 있다고 지적합니다.”

배경
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염색체는 DNA (유기체의 유전 물질을 함유 함)와 DNA를 포장하고 압축에그 슬롯 데 도움이되는 단백질 분자의 복잡한 생체 분자 제작입니다. 염색체는 세포 핵에 위치하고 있습니다. 그것들은 염색체의 복제가 발생한 직후, 두 염색체 사본이 여전히 결합되고 가장 응축 된 형태로 염색체의 복제 직후에 세포 분열의 특정 상 (중기 부도) 동안 광학 현미경으로 만 관찰 될 수 있습니다.

셀 이미지의 서열은 이제 가벼운 현미경을 통해 일상적으로 기록 될 수 있지만,이를 분석하는 것은 주로 수동으로 지루한 작업입니다. 에그 슬롯사이트ma University의 Nagaki Kiyotaka 부교수와 동료들은 이제 기계 학습 기술을 기반으로 그래픽 사용자 인터페이스를 기반으로 사용자 친화적 인 컴퓨터 프로그램을 개발했으며, 셀 디비전 (예 : 크로 모솜 표시가 가능합니다).

참조
Kiyotaka Nagaki, Tomoyuki Furuta, Naoki Yamaji, Daichi Kuniyoshi, Megumi Ishihara, Yuji Kishima, Minoru Murata, Atsushi Hoshino 및 Hirotomo Takatsuka. 현미경 이미지 분류에서 ML 생성 효과 : 비 데이터 과학자를위한 간단하고 저렴한 딥 러닝 파이프 라인. 염색체 에그 슬롯. 출판 : 2021 년 10 월 14 일.
doi : 10.1007/s10577-021-09676-z
https : //link.springer.com/article/10.1007/s10577-021-09676-z


서신
부교수 에그 슬롯 Kiyotaka, Ph.D.
통합 게놈 육종 그룹, 공장 에그 슬롯소
과학 및 자원, 쿠라 시키, 쿠라 시키 에그 슬롯교,
710-0046, 일본.
이메일 : 나가키 (a) rib.에그 슬롯.ac.jp

문의 사항은 (a) @ Mark.

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